数据预处理
未经处理的特征有以下问题:
- 不属于同一量纲:即特征的规格不一样,不能够放在一起比较。无量纲化可以解决这一问题。
- 信息冗余:对于某些定量特征,其包含的有效信息为区间划分。例如学习成绩,假若只关心“及格”或不“及格”,那么需要将定量的考分,转换成“1”和“0”表示及格和未及格。二值化可以解决这一问题。
- 定性特征不能直接使用:某些机器学习算法和模型只能接受定量特征的输入,那么需要将定性特征转换为定量特征。最简单的方式是为每一种定性值指定一个定量值,但是这种方式过于灵活,增加了调参的工作。通常使用独热编码的方式将定性特征转换为定量特征:假设有N种定性值,则将这一个特征扩展为N种特征,当原始特征值为第i种定性值时,第i个扩展特征赋值为1,其他扩展特征赋值为0。独热编码的方式相比直接指定的方式,不用增加调参的工作,对于线性模型来说,使用哑编码后的特征可达到非线性的效果。
- 存在缺失值:缺失值需要补充。
- 信息利用率低:不同的机器学习算法和模型对数据中信息的利用是不同的,在线性模型中,使用对定性特征哑编码可以达到非线性的效果。类似地,对定量变量多项式化,或者进行其他的转换,都能达到非线性的效果。
无量纲化
无量纲化使不同规格的数据转换到同一规格。常见的无量纲化方法有标准化和区间缩放法。标准化的前提是特征值服从正态分布,标准化后,其转换成标准正态分布。区间缩放法利用了边界值信息,将特征的取值区间缩放到某个特点的范围,例如[0, 1]等。
标准化
标准化需要计算特征的均值和标准差。
使用preproccessing库的StandardScaler类对数据进行标准化:1
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4from sklearn.preprocessing import StandardScaler
# 标准化 返回值为标准化后的数据
StandardScaler().fit_transform(iris.data)
区间缩放法
常见的为利用最值进行缩放:
使用preproccessing库的MinMaxScaler类对数据进行区间缩放:1
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4from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler
# 区间缩放 返回值为缩放到[0, 1]区间的数据
MinMaxScaler().fit_transform(iris.data)
标准化与归一化的区别
标准化是依照特征矩阵的列处理数据,其通过求z-score的方法,将样本的特征值转换到同一量纲下。
归一化是依照特征矩阵的行处理数据,其目的在于样本向量在点乘运算或其他核函数计算相似性时,拥有统一的标准,也就是说都转化为“单位向量”。
使用preproccessing库的Normalizer类对数据进行归一化:1
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4from sklearn.preprocessing import Normalizer
# 归一化 返回值为归一化后的数据
Normalizer().fit_transform(iris.data)
对定量特征二值化
设定一个阈值,大于阈值的赋值为1,小于等于阈值的赋值为0:
使用preproccessing库的Binarizer类对数据进行二值化:1
2
3
4from sklearn.preprocessing import Binarizer
# 二值化,阈值设置为3,返回值为二值化后的数据
3).fit_transform(iris.data) Binarizer(threshold=
对定性特征独热编码
使用preproccessing库的OneHotEncoder类对数据进行独热编码:1
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4from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder
# 独热编码,对IRIS数据集的目标值,返回值为独热编码后的数据
-1,1))) OneHotEncoder().fit_transform(iris.target.reshape((
缺失值计算
使用preproccessing库的Imputer类对数据进行缺失值计算:1
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11from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures
# 多项式转换
# 参数degree为度,默认值为2
PolynomialFeatures(degree=3).fit_transform(iris.data)from numpy import vstack, array, nan
from sklearn.preprocessing import Imputer
# 缺失值计算,返回值为计算缺失值后的数据
# 参数 missing_value 为缺失值的表示形式,默认为 NaN
# 参数 strategy 为缺失值填充方式,默认为mean(均值)
Imputer().fit_transform(vstack((array([nan, nan, nan, nan]), iris.data)))
数据变换
常见的数据变换有基于多项式的、基于指数函数的、基于对数函数的。
使用preproccessing库的PolynomialFeatures类对数据进行多项式转换:1
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5from sklearn.preprocessing import PolynomialFeatures
# 多项式转换
# 参数degree为度,默认值为2
3).fit_transform(iris.data) PolynomialFeatures(degree=
基于单变元函数的数据变换可以使用一个统一的方式完成,使用preproccessing库的FunctionTransformer对数据进行对数函数转换:1
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6from numpy import log1p
from sklearn.preprocessing import FunctionTransformer
# 自定义转换函数为对数函数的数据变换
# 第一个参数是单变元函数
FunctionTransformer(log1p).fit_transform(iris.data)
特征选择
预处理完成后,需要选择有意义的特征输入机器学习的算法和模型进行训练。通常来说,从两个方面考虑来选择特征:
特征是否发散:如果一个特征不发散,例如方差接近于0,也就是说样本在这个特征上基本上没有差异,这个特征对于样本的区分并没有什么用。
特征与目标的相关性:这点比较显见,与目标相关性高的特征,应当优选选择。除方差法外,本文介绍的其他方法均从相关性考虑。
根据特征选择的形式又可以将特征选择方法分为3种:
Filter:过滤法。按照发散性或者相关性对各个特征进行评分,设定阈值或者待选择阈值的个数,选择特征。
Wrapper:包装法。根据目标函数(通常是预测效果评分),每次选择若干特征,或者排除若干特征。
Embedded:嵌入法。先使用某些机器学习的算法和模型进行训练,得到各个特征的权值系数,根据系数从大到小选择特征。类似于Filter方法,但是是通过训练来确定特征的优劣。
使用sklearn中的feature_selection库来进行特征选择。
Filter
方差选择法
使用方差选择法,先要计算各个特征的方差,然后根据阈值,选择方差大于阈值的特征。
使用feature_selection库的VarianceThreshold类来选择特征:1
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5from sklearn.feature_selection import VarianceThreshold
# 方差选择法,返回值为特征选择后的数据
# 参数threshold为方差的阈值
3).fit_transform(iris.data) VarianceThreshold(threshold=
相关系数法
使用相关系数法,先要计算各个特征对目标值的相关系数以及相关系数的P值。
用feature_selection库的SelectKBest类结合相关系数来选择特征:1
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7from sklearn.feature_selection import SelectKBest
from scipy.stats import pearsonr
# 选择K个最好的特征,返回选择特征后的数据
# 第一个参数为计算评估特征是否好的函数,该函数输入特征矩阵和目标向量,输出二元组(评分,P值)的数组,数组第i项为第i个特征的评分和P值。在此定义为计算相关系数
# 参数k为选择的特征个数
lambda X, Y: list(array([pearsonr(x, Y) for x in X.T]).T, k=2).fit_transform(iris.data, iris.target)) SelectKBest(
卡方检验
经典的卡方检验是检验定性自变量对定性因变量的相关性。假设自变量有N种取值,因变量有M种取值,考虑自变量等于i且因变量等于j的样本频数的观察值与期望的差距,构建统计量:
这个统计量的含义简而言之就是自变量对因变量的相关性。
用feature_selection库的SelectKBest类结合卡方检验来选择特征:1
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5from sklearn.feature_selection import SelectKBest
from sklearn.feature_selection import chi2
# 选择K个最好的特征,返回选择特征后的数据
2).fit_transform(iris.data, iris.target) SelectKBest(chi2, k=
互信息法
经典的互信息也是评价定性自变量对定性因变量的相关性。
Wrapper
递归特征消除法
递归消除特征法使用一个基模型来进行多轮训练,每轮训练后,消除若干权值系数的特征,再基于新的特征集进行下一轮训练。
使用feature_selection库的RFE类来选择特征:1
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7from sklearn.feature_selection import RFE
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
# 递归特征消除法,返回特征选择后的数据
# 参数estimator为基模型
# 参数n_features_to_select为选择的特征个数
2).fit_transform(iris.data, iris.target) RFE(estimator=LogisticRegression(), n_features_to_select=
Embedded
基于惩罚项的特征选择法
使用带惩罚项的基模型,除了筛选出特征外,同时也进行了降维。
使用feature_selection库的SelectFromModel类结合带L1惩罚项的逻辑回归模型,来选择特征:1
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5from sklearn.feature_selection import SelectFromModel
from sklearn.linear_model import LogisticRegression
#带L1惩罚项的逻辑回归作为基模型的特征选择
"l1", C=0.1)).fit_transform(iris.data, iris.target) SelectFromModel(LogisticRegression(penalty=
基于树模型的特征选择法
树模型中GBDT也可用来作为基模型进行特征选择。
使用feature_selection库的SelectFromModel类结合GBDT模型,来选择特征:1
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5from sklearn.feature_selection import SelectFromModel
from sklearn.ensemble import GradientBoostingClassifier
# GBDT作为基模型的特征选择
SelectFromModel(GradientBoostingClassifier()).fit_transform(iris.data, iris.target)
降维
当特征选择完成后,可以直接训练模型了,但是可能由于特征矩阵过大,导致计算量大,训练时间长的问题,因此降低特征矩阵维度也是必不可少的。常见的降维方法除了以上提到的基于L1惩罚项的模型以外,另外还有主成分分析法(PCA)和线性判别分析(LDA),线性判别分析本身也是一个分类模型。PCA和LDA有很多的相似点,其本质是要将原始的样本映射到维度更低的样本空间中,但是PCA和LDA的映射目标不一样:PCA是为了让映射后的样本具有最大的发散性;而LDA是为了让映射后的样本有最好的分类性能。所以说PCA是一种无监督的降维方法,而LDA是一种有监督的降维方法。
主成分分析法(PCA)
使用decomposition库的PCA类选择特征:1
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5from sklearn.decomposition import PCA
# 主成分分析法,返回降维后的数据
# 参数n_components为主成分数目
3).fit_transform(iris.data) PCA(n_components=
线性判别分析法(LDA)
使用lda库的LDA类选择特征:1
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5from sklearn.discriminant_analysis import LinearDiscriminantAnalysis as LDA
# 线性判别分析法,返回降维后的数据
# 参数n_components为降维后的维数
2).fit_transform(iris.data, iris.target) LDA(n_components=